Challex est une variante de Challes et ils partagent étymologie identique dérivant du latin Calliacum désigant un enclos à bétail.
En des temps reculés et lointains, le bétail avait précieuse importance et les enclos étaient lieux importants. Celui-ci, probablement pérenne et remarquable, le fut suffisamment pour y créer le toponyme actuel.
La graphie Challex permet de le différencier de celui de Challes-la-Montagne.
Il existe plusieurs formes anciennes connues ; ainsi nous retrouvons un Chaloes au XIV° siècle, puis un Chalois au XIV° siècle - rappelant le mot Chalet. Les siècles suivant se voient sous les formes Chaloex et Chalay, XIV° siècle ; puis Chalex et Challaix au XVIII° siècle...
