Arnayon, en provençal Arnavoun, est attesté avec certitude sous sa forme latine en l'an 1127 avec un Ecclesia Beatœ de Arnayone, forme toponymique ancienne que nous pouvons lire dans le cartulaire de l'Abbaye de Saint Ruf à Avignon. Nous retrouvons ce toponyme en 1127, dans les mêmes sources, avec un Ecclesia Beatæ Mariæ de Arnayone puis un Ecclesia Arnayonis en 1190. C'est le rôle des décimes locales de l'année 1580 qui nous dévoilera un Arnaïon.
Certaines interprétations capillotractées font dériver ce toponyme d'un radical belge Arn = aigle en citant du Cange mais cela est bien surprenant. Un toponyme se devant d'être précis et définir un lieu avec fiabilité, restant chez du Cange, nous pencherions plutôt pour un Arn = ruche ; ceci rappelant probablement la présence d'apiculteurs en ce lieu.
Un temps lointain fut où le sucre était denrée rare et précieuse - en certaines régions, détruire une ruche voyait peine de mort, définir un lieu par la présence de ruches permettait donc localisation précise et certaine ; ceci restant hypothèse.
Arnayon est aussi l'hydronyme du torrent présent sur la commune.
Le radical -Arn- ou -Ar- se retrouve dans multiples hydronymes comme l'Arnette, le Tarn, l'Orne, l'Arnave, etc. Cela nous permettrait-il quelques rapprochements avec le toponyme Arnayon ?
