Richesse arrivant, l'Abbaye vit débuter une longue série de procès qui lui furent intentées ou qu'elle intenta pour protéger ses biens et revenus. Nombreux furent les procès contre les habitants de Lorgues et les moines de l'Abbaye du Tholonet semblent avoir été plus heureux que ceux de l'Agnielles-en-Bochaîne qui connurent plaies, bosses et horions offerts par leurs voisins.
Le le Souverain Pontife Sixte IV, par bulle du 10 février 1474, souhaite réunir l'Abbaye de Thoronet l'évêché de Fréjus, au bénéfice d'Urbain de Fiesque, son évêque. L'Abbaye estera alors en Justice contre le Pape et, grâce à l'appui du Roi de France, Charles VII , dit Le Victorieux, gagner son procès. La décision de justice est actée le 11 août de la même année.
